SG/ROX qPCR Master Mix (2x) to uniwersalny roztwór do ilościowej reakcji PCR w czasie rzeczywistym i dwuetapowej RT-PCR w czasie rzeczywistym, który można stosować w większości dostępnych cyklerów typu „real-time”. Mieszanina reakcyjna zawiera polimerazę Perpetual Taq DNA, zoptymalizowany bufor reakcyjny, dNTP (dTTP jest częściowo zastąpiony przez dUTP), barwnik SYBR Green I oraz barwnik ROX. SYBR Green I umożliwia analizę DNA bez konieczności syntezowania kosztownych specyficznych dla sekwencji znakowanych sond.

SG/ROX qPCR Master Mix (2x) zawiera dUTP, który częściowo zastępuje dTTP. Umożliwia to opcjonalne zastosowanie N-glikozylazy uracylu (UNG), aby zapobiec przenoszeniu zanieczyszczeń pomiędzy reakcjami podczas ich przygotowywania. UNG usuwa uracyl z wszelkich zanieczyszczających amplikonów zawierających dU, pozostawiając miejsca bezzasadne i powodując, że cząsteczki DNA są podatne na hydrolizę podczas początkowego etapu denaturacji.

Zastosowanie pasywnego barwnika referencyjnego ROX jest konieczne we wszystkich cyklerach Applied Biosystems i opcjonalnie w cyklerach Stratagene. ROX kompensuje zmiany sygnału fluorescencyjnego między dołkami ze względu na niewielkie różnice w objętości reakcji i fluktuacjach fluorescencji. ROX nie bierze udziału w reakcji PCR, ma inne spektrum emisyjne niż SYBR Green I i nie zakłóca reakcji PCR.