MP qPCR Master Mix (2x) to uniwersalne rozwiązanie dla ilościowej reakcji „multiplex” Real-Time PCR i dwuetapowej reakcji RT-PCR w czasie rzeczywistym. W zależności od zastosowanego termocyklera, możemy oznaczyć 5 matryc w jednej probówce. MP qPCR Master Mix (2x) zawiera OnTaq polimerazę DNA, zoptymalizowany bufor reakcyjny, dNTP (dTTP jest częściowo zastąpiony dUTP). Polimeraza umożliwia wygodne ustawienie reakcji w temperaturze pokojowej. MP qPCR Master Mix (2x) zawiera dUTP, który częściowo zastępuje dTTP. Umożliwia opcjonalne zastosowanie uracyl-N-glikozylazy (UNG), aby zapobiec zanieczyszczeniom między reakcjami. UNG usuwa uracyl z wszelkich zanieczyszczonych amplikonów zawierających dU, pozostawiając miejsca pozbawione zasad, czyniąc cząsteczki DNA podatnymi na hydrolizę podczas początkowego etapu denaturacji.

W przypadku zastosowania termocyklerów firmy Applied Biosystems konieczna jest zastosowanie pasywnego barwnika referencyjnego ROX. MP qPCR Master Mix (2x) jest dostarczany w dwóch wariantach: bez barwnika ROX oraz z barwnikiem ROX dostępnym oddzielnie. Barwnik ROX kompensuje zmiany sygnału fluorescencyjnego między studzienkami wynikające z niewielkich różnic w objętości reakcji. ROX nie bierze udziału w reakcji PCR, ma inne spektrum emisji niż SYBR Green I i nie zakłóca reakcji PCR w czasie rzeczywistym na żadnym termocyklerze.