GeneMATRIX Basic DNA Purification Kit jest podstawowym narzędziem przydatnym w każdym laboratorium pracującym z DNA. Pozwala na wykonanie trzech elementarnych technik laboratoryjnych: oczyszczania DNA po obróbce enzymatycznej, izolacji DNA z żeli agarozowych oraz izolacji DNA plazmidowego z hodowli bakteryjnych. Łącząc w sobie te możliwości zestaw wpływa na usprawnienie pracy i pozwala na zminimalizowanie kosztów projektów naukowych.
Protokół „Oczyszczanie PCR/DNA” pozwala na szybkie oczyszczenie m. in. produktów PCR, fragmentów restrykcyjnych, molekuł DNA po obróbce enzymatycznej oraz znakowaniu izotopowym lub chemicznym. Protokół jest zoptymalizowany w celu wiązania fragmentów DNA w szerokim zakresie wielkości (od 100 bp do ponad 15 kb) oraz w celu usuwania sprawiających szczególne trudności inhibitorów restrykcji i ligacji DNA. Zestaw pozwala na efektywnie usuwane z próbki DNA zanieczyszczeń takich jak: bromek etydyny, primery (poniżej 40 nt), krótkie odcinki dwuniciowego DNA (poniżej 20 pz), znaczniki radioaktywne i nieradioaktywne, detergenty, związki buforowe, sole, EDTA, inhibitory, barwniki, enzymy restrykcyjne, egzonukleazy i endonukleazy, RNA, Taq DNA polimerazę, Pfu DNA polimerazę, BSA, białka modyfikujące DNA i inne.
Protokół „Izolacja z Agarozy” pozwala na szybkie oczyszczenie liniowych lub kolistych cząsteczek DNA o wielkości od ok. 100 pz do ponad 10 kpz, rozdzielanych na TAE- lub TBE-żelu agarozowym. Poza usunięciem agarozy z próbki DNA efektywnie usuwane są zanieczyszczenia takie jak: bromek etydyny, RNA, nukleotydy, primery, znaczniki radioaktywne i nieradioaktywne, detergenty, związki buforowe, sole, EDTA, inhibitory restrykcji i ligacji DNA, barwniki, enzymy i inne białka.
Protokół „Izolacja DNA Plazmidowego” pozwala na szybkie uzyskanie plazmidowego DNA o bardzo wysokiej czystości z różnorodnych gatunków bakterii, w tym rekombinowanej Escherichia coli. Z surowego lizatu bakteryjnego efektywnie usuwane są zanieczyszczenia takie jak: genomowe DNA, RNA, białka, lipidy, barwniki, detergenty, związki buforowe, sole. Komponenty użyte do konstrukcji zestawu zostały zoptymalizowana pod kątem usuwania uciążliwych inhibitorów restrykcji DNA oraz niespecyficznych endo- i egzonukleaz z lizatu bakteryjnego. Zabarwiony bufor lizujący ułatwia śledzenie dokładności wymieszania zawiesiny bakterii z buforem, postępu uwalniania zawartości komórek oraz jednoczesną pracę z wieloma próbkami.
We wszystkich protokołach dodanie specjalnego buforu wytwarza warunki do selektywnego wiązania DNA do membran. Podczas krótkiego wirowania następuje wiązanie DNA, natomiast niezwiązane zanieczyszczenia pozostają w wycieku z kolumny. Ich śladowe pozostałości na membranie są skutecznie usuwane w trakcie dwóch etapów płukania. Elucję oczyszczonego DNA wykonuje się buforem niskosolnym, np.: zawierającym Tris-HCl, TE lub wodą destylowaną. Oczyszczony preparat DNA nadaje się do bezpośredniego użytku. Nie wymaga dalszej precypitacji etanolem.
